只有土地有補償嗎?土地上的農作物或房舍有補償嗎? 
本案徵收補償分為土地補償、地上物補償及施工獎勵金三大項︰

1.私有土地徵收補償/公有土地承租補償

按土地徵收條例規定:「被徵收之土地,應按照徵收當期之市價補償其地價。」、「需用土地人申請徵收土地或土地改良物前,…應先與所有權人協議價購或以其他方式取得;…協議價購應由需用土地人依市價與所有權人協議。…所稱市價,指市場正常交易價格。」本案市價資訊參考資來源包括:縣市政府所提供之徵收補償市價、一般正常交易價格、縣市政府地價單位提供之市價資訊、實價登錄、不動產仲介業之相關資訊及參考鄰近土地買賣案例等參考資訊。實價登錄之價格僅為本案市價參考資訊之一。而原承租公有土地耕作者,則以核准撥用當期土地公告現值之三分之一估計其補償費。

2.地上物補償

依土地徵收條例,徵收用地或承租公有土地受撥用者,其上合法之土地改良物將給予補償,其補償費依據「南投縣辦理徵收土地農作物及水產養殖物畜禽補償遷移費查估基準」及「南投縣興辦公共工程拆遷建築改良物補償及獎勵辦法」補償標準辦理。

至於非法之土地改良物,則依上開標準查估後比照「經濟部水利事業工程用地核發獎勵金及救濟金要點」、「經濟部水利署興辦水利工程使用河川及區域排水公有土地救濟方案協商原則」規定給予救濟。

3.施工獎勵金

符合「經濟部水利工程事業工程用地核發獎勵金及救濟金要點」之獎勵項目及標準者,將核發私有土地120元/平方公尺、公有土地40元/平方公尺施工獎勵金。